Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKAA1Q13131 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms