Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXD4Q12950 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXD4Q12950 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXD4Q12950 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXD4Q12950 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
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