Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXC1Q12948 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXC1Q12948 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXC1Q12948 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXC1Q12948 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXC1Q12948 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXC1Q12948 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXC1Q12948 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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