Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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