Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms