Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms