Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF6P49848 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF6P49848 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms