Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD4P46934 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD4P46934 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD4P46934 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD4P46934 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD4P46934 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD4P46934 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD4P46934 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD4P46934 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms