Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBX2P40425 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBX2P40425 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms