Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CTRLP40313 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CTRLP40313 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms