Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK1P39086 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms