Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PLNP26678 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.8 ms