Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms