Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms