Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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