Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms