Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DESP17661 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DESP17661 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DESP17661 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms