Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC172P0C7W6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms