Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms