Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms