Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGAVP06756 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms