Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms