Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGTAO43765 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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