Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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