Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms