Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms