Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP69A5D8W1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms