Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA8A3KMH1 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms