Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms