Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL4A3BPQ9Y5P4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms