Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB1Q9Y5F3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB1Q9Y5F3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB1Q9Y5F3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms