Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB4Q9Y5E5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB4Q9Y5E5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms