Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF6Q9Y4K3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms