Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC44.4■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC44.39■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC44.37■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.35■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC44.34■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
DCAF1Q9Y4B6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC44.3■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
DCAF1Q9Y4B6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC44.25■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms