Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms