Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COQ4Q9Y3A0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms