Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MRPS28Q9Y2Q9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms