Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIKFYVEQ9Y2I7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIKFYVEQ9Y2I7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms