Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTN6Q9UQ52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN6Q9UQ52 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms