Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF24Q9UPV7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF24Q9UPV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF24Q9UPV7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF24Q9UPV7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF24Q9UPV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms