Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4E1Q9UPM8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms