Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1LQ9UNN4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1LQ9UNN4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms