Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms