Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF1Q9UMS5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms