Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF19Q9UMS4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms