Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms