Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB3Q9ULL4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms