Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH3Q9ULD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNH3Q9ULD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNH3Q9ULD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms