Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKLN1Q9UL63 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MKLN1Q9UL63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms