Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL4Q9UKA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL4Q9UKA2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms